Skema desain lan solusi rantai peptida polipeptida

I. Ringkesan
Peptida minangka makromolekul khusus sing urutane ora biasa ing fitur kimia lan fisike.Sawetara peptida angel disintesis, dene liyane gampang disintesis nanging angel diresiki.Masalah praktis yaiku umume peptida rada larut ing larutan banyu, saéngga ing pemurnian kita, bagean sing cocog saka peptida hidrofobik kudu larut ing pelarut non-air, Mulane, pelarut utawa buffer iki bisa uga ora konsisten karo panggunaan. saka prosedur eksperimen biologi, supaya teknisi dilarang banget nggunakake peptida kanggo tujuane dhewe, supaya ing ngisor iki ana sawetara aspek desain peptida kanggo peneliti.

Skema desain lan solusi rantai peptida polipeptida
Kapindho, pilihan sing bener saka peptida angel sintetik
1. Total dawa urutan mudhun-diatur
Peptida kurang saka 15 residu luwih gampang dipikolehi amarga ukuran peptida mundhak lan kemurnian produk mentah mudhun.Amarga dawa total rantai peptida mundhak ngluwihi 20 residu, jumlah produk sing tepat dadi masalah utama.Ing pirang-pirang eksperimen, gampang entuk efek sing ora dikarepake kanthi ngedhunake jumlah residu ing ngisor 20.
2. Ngurangi jumlah residu hidrofobik
Peptida kanthi dominasi residu hidrofobik, utamane ing wilayah 7-12 residu saka terminal C, biasane nyebabake kesulitan sintetik.Iki katon minangka kombinasi sing ora nyukupi amarga lembaran B-fold dijupuk ing sintesis."Ing kasus kaya mengkono, bisa uga migunani kanggo ngowahi luwih saka rong residu positif lan negatif, utawa sijine Gly utawa Pro menyang peptida kanggo mbukak kunci komposisi peptida."
3. Downregulation saka residu "angel".
"Ana sawetara residu Cys, Met, Arg, lan Try sing umume ora gampang disintesis."Ser biasane digunakake minangka alternatif nonoksidatif kanggo Cys.
Skema desain lan solusi rantai peptida polipeptida

Katelu, nambah pilihan sing bener larut ing banyu
1. Nyetel terminal N utawa C
Relatif karo peptida asam (yaiku, muatan negatif ing pH 7), asetilasi (asetilasi N-terminus, terminal C tansah njaga gugus karboksil bebas) utamané dianjurake kanggo nambah muatan negatif.Nanging, kanggo peptida dhasar (yaiku, kanthi muatan positif ing pH 7), aminasi (gugus amino gratis ing terminal N lan aminasi ing terminal C) dianjurake kanggo nambah muatan positif.

2. Nyepetake utawa ndawakake urutane

Sawetara urutan ngemot akeh asam amino hidrofobik, kayata Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr lan Ala, lan liya-liyane. Nalika residu hidrofobik iki ngluwihi 50%, biasane ora gampang larut.Bisa uga migunani kanggo ndawakake urutan kanggo nambah kutub positif lan negatif saka peptida.Pilihan kapindho yaiku ngurangi ukuran rantai peptida kanggo nambah kutub positif lan negatif kanthi ngurangi residu hidrofobik.Sing kuwat sisih positif lan negatif saka chain peptida, luwih kamungkinan kanggo reaksi karo banyu.
3. Sijine ing ampas banyu-telat
Kanggo sawetara ranté peptida, kombinasi sawetara asam amino positif lan negatif bisa nambah kelarutan banyu.Perusahaan kita nyaranake N-terminus utawa C-terminus peptida asam supaya digabungake karo Glu-Glu.Terminal N utawa C saka peptida dhasar diwenehi lan banjur Lys-Lys.Yen klompok sing diisi ora bisa diselehake, Ser-Gly-Ser uga bisa diselehake ing terminal N utawa C.Nanging, pendekatan iki ora bisa digunakake nalika sisi rantai peptida ora bisa diganti.