Ana macem-macem jinis peptida transmembrane, lan klasifikasi kasebut adhedhasar sifat fisik lan kimia, sumber, mekanisme ingestion, lan aplikasi biomedis.Miturut sifat fisik lan kimia, peptida penetrating membran bisa dipérang dadi telung jinis: kationik, amphiphilic lan hidrofobik.Peptida penetrating membran kationik lan amphiphilic 85%, dene peptida penetrating membran hidrofobik mung 15%.
1. Membran kationik penetrating peptida
Peptida transmembran kationik kasusun saka peptida cendhak sing sugih arginine, lisin, lan histidin, kayata TAT, Penetratin, Poliarginin, P22N, DPV3 lan DPV6.Antarane wong-wong mau, arginine ngandhut guanidine, sing bisa ikatan hidrogen karo gugus asam fosfat sing muatan negatif ing membran sel lan mediasi peptida transmembrane menyang membran ing kondisi nilai PH fisiologis.Studi babagan oligarginine (saka 3 R nganti 12 R) nuduhake yen kemampuan penetrasi membran mung digayuh nalika jumlah arginin kurang saka 8, lan kemampuan penetrasi membran mboko sithik mundhak kanthi nambah jumlah arginin.Lysine, sanajan kationik kaya arginin, ora ngandhut guanidine, mula yen ana piyambak, efisiensi penetrasi membran ora dhuwur banget.Futaki et al.(2001) nemokake efek penetrasi membran sing apik mung nalika peptida penetrating membran sel kationik ngemot paling ora 8 asam amino sing muatane positif.Sanajan residu asam amino sing diisi positif penting kanggo peptida penetrasi kanggo nembus membran, asam amino liyane uga penting, kayata nalika W14 mutasi dadi F, penetrasi Penetratin ilang.
Kelas khusus peptida transmembrane kationik yaiku urutan lokalisasi nuklir (NLSs), sing kasusun saka peptida cendhak sing sugih arginine, lisin lan prolin lan bisa diangkut menyang inti liwat kompleks pori nuklir.NLSs bisa dipérang manèh dadi siji lan pindho ngetik, dumadi saka siji lan loro klompok asam amino dhasar, mungguh.Contone, PKKKRKV saka virus simian 40(SV40) minangka NLS ngetik tunggal, dene protein nuklir minangka NLS ngetik ganda.KRPAATKKAGQAKKKL minangka urutan cendhak sing bisa nduweni peran ing transmembran membran.Amarga umume NLS duwe nomer pangisian daya kurang saka 8, NLS dudu peptida transmembrane sing efektif, nanging bisa dadi peptida transmembrane sing efektif nalika disambungake sacara kovalen karo urutan peptida hidrofobik kanggo mbentuk peptida transmembran amphiphilic.
2. Peptida transmembran amphifilik
Peptida transmembrane amfifilik kasusun saka domain hidrofilik lan hidrofobik, sing bisa dipérang dadi amphiphilic primer, amphiphilic α-heliks sekunder, amphiphilic β-folding lan amphiphilic prolin-enriched.
Peptida membran nganggo amphiphilic primer dadi rong kategori, kategori karo NLSs sing disambungake kanthi kovalen kanthi urutan peptida hidrofobik, kayata MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) lan Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Loro-lorone adhedhasar sinyal lokalisasi nuklir PK40RKV, sing adhedhasar sinyal lokalisasi nuklir SVKKRKV. domain MPG ana hubungane karo urutan fusi glikoprotein HIV 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), lan domain hidrofobik Pep-1 ana hubungane karo klompok kaya tryptophan kanthi afinitas membran dhuwur (KETWWET WWTEW).Nanging, domain hidrofobik saka loro disambungake karo sinyal lokalisasi nuklir PKKKRKV liwat WSQP.Kelas liyane saka peptida transmembrane amphiphilic primer diisolasi saka protein alam, kayata pVEC, ARF(1-22) lan BPrPr(1-28).
Peptida transmembran amphiphilic α-heliks sekunder ngiket membran liwat α-heliks, lan residu asam amino hidrofilik lan hidrofobik dumunung ing permukaan sing beda saka struktur heliks, kayata MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Kanggo membran nyandhang amphiphilic jinis lempitan peptida beta, kemampuan kanggo mbentuk lembaran lipit beta penting banget kanggo kemampuan penetrasi membran, kayata ing VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) ing proses riset kemampuan penetrasi membran, nggunakake jinis D. - Analog mutasi asam amino ora bisa mbentuk potongan beta lempitan, kemampuan penetrasi membran banget miskin.Ing peptida transmembrane amphiphilic sing diperkaya proline, poliprolin II (PPII) gampang dibentuk ing banyu murni nalika prolin diperkaya ing struktur polipeptida.PPII minangka heliks kiwa kanthi 3,0 residu asam amino saben giliran, minangka lawan saka struktur alpha-helix tangan tengen standar kanthi 3,6 residu asam amino saben giliran.Peptida transmembran amphiphilic sing diperkaya proline kalebu peptida antimikroba sapi 7 (Bac7), polipeptida sintetik (PPR) n (n bisa dadi 3, 4, 5 lan 6), lsp.
3. Membran hidrofobik penetrating peptida
Peptida transmembran hidrofobik mung ngemot residu asam amino non-polar, kanthi muatan net kurang saka 20% saka total muatan urutan asam amino, utawa ngemot gugus hidrofobik utawa gugus kimia sing penting kanggo transmembrane.Sanajan peptida transmembran seluler iki asring diabaikan, nanging ana, kayata faktor pertumbuhan fibroblast (K-FGF) lan faktor pertumbuhan fibroblast 12 (F-GF12) saka sarkoma Kaposi.
Posting wektu: Mar-19-2023